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Python数据存储之 h5py详解

时间:2021-07-15 09:30:51|栏目:Python代码|点击:

1、Python数据存储(压缩)

(1)numpy.save , numpy.savez , scipy.io.savemat

numpy和scipy内建的数据存储方式。

(2)cPickle + gzip

cPickle是pickle内建的数据存储方式,gzip是常用的文件压缩模块。

(3)h5py

h5py是对HDF5文件格式进行读写的python包,关于h5py更多介绍与安装,参考官方网站

关于HDF5,参考官方网站。:

一个HDF5文件就是一个由两种基本数据对象(groups and datasets)存放多种科学数据的容器:

HDF5 dataset: 数据元素的一个多维数组以及支持元数据(metadata); HDF5 group: 包含0个或多个HDF5对象以及支持元数据(metadata)的一个群组结构;

总之,dataset是类似于数组的数据集,而group是类似文件夹一样的容器,存放dataset和其他group;group和dataset在h5py中的使用有点类似于词典和Numpy中数组的用法。

h5py的优势:速度快、压缩效率高,总之,numpy.savez和cPickle存储work或不work的都可以试一试h5py!

2、h5py读取和存储数据示例

import h5py
X= np.random.rand(100, 1000, 1000).astype('float32')
y = np.random.rand(1, 1000, 1000).astype('float32')

# Create a new file
f = h5py.File('data.h5', 'w')
f.create_dataset('X_train', data=X)
f.create_dataset('y_train', data=y)
f.close()

# Load hdf5 dataset
f = h5py.File('data.h5', 'r')
X = f['X_train']
Y = f['y_train']
f.close()

详细使用方法,参考官网

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本文标题:Python数据存储之 h5py详解

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