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R语言绘制Radar chart雷达图

时间:2022-06-22 09:39:19|栏目:|点击:

对于导出带有透明度的高清图,小仙又发现了更懒的办法,特来更新

在这里插入图片描述

再Rstudio里调整好透明度之后,直接导出pdf,然后用Adobe illustrator打开pdf文件,直接导出png或jpeg就可以啦

更新前原文

今天小仙同学给大家分享下Radar chart的作图方法,其实雷达图我们在生活中能经常可以见到,比如大家很喜欢玩的王者荣耀里就有。通过简单的图形对比,人物特点一目了然。

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也经常用来评估学生的成绩和产品的性能。

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在生信领域,我们也可以用来比较评估样品的基因表达情况啦。

作图数据如下:

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画出来的效果图如下:

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作图方法:

Step1. 绘图数据的准备

首先还是要把你想要绘图的数据调整成R语言可以识别的格式excel中保存成csv格式。数据的格式就在上面啦。

Step2. 绘图数据的读取

data<-read.csv(“your file path”, header = T)

Step3.绘图所需package的安装、调用

install.packages("fmsb")
library(fmsb)

Step4.绘图数据格式调整

radarfig<-rbind(rep(15,10),rep(0,10),data)

#在原有的数据上增加了两行,
#第一、二行分别是每个纵轴的最大值、最小值,也可手动添加

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Step5.绘图

radarchart(radarfig, axistype=1,
            pcol=rgb(69/255,137/255,137/255) , pfcol=rgb(69/255,137/255,137/255,0.6),    
            plwd=4 ,seg=5,
            cglcol="grey", cglty=1, cglwd=2,axislabcol="black" ,caxislabels=seq(0,15,3),
            vlcex=0.7,calcex=0.7)

如果从RStudio直接导出png或者jpeg格式的图片,还是会有之前小仙同学提过的**“锯齿状”线条**。之前的解决方案是导出eps格式,在Adobe Illustrator里打开再导出成需要的格式。但本小仙发现一个“巨坑”,就是RStudio导出的eps图形没有透明度,需要在AI里手动调整透明图。
(其实R代码的这一部分本小仙很快就写好了 ,调整填充透明度费了老大劲,实名diss此bug)

填充透明度调整方法如下:

1.取消编组

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2.选中线条,对象—实时上色—建立

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3.选中线条,对象—拓展

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4.更改填充颜色,输入相应颜色RGB数值

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5.删掉图形白色背景

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6.外观—填色—不透明度—调整数值

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